MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 35793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
2	NC_006570	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	56707188
3	NC_006570	A	8	8	69	76	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
4	NC_006570	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
5	NC_006570	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
6	NC_006570	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707188
7	NC_006570	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
8	NC_006570	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707188
9	NC_006570	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
10	NC_006570	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
11	NC_006570	T	7	7	327	333	0 %	100 %	0 %	0 %	56707188
12	NC_006570	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707188
13	NC_006570	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
14	NC_006570	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707188
15	NC_006570	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
16	NC_006570	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
17	NC_006570	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
18	NC_006570	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707188
19	NC_006570	AGC	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707188
20	NC_006570	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707188
21	NC_006570	GCAA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	56707188
22	NC_006570	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
23	NC_006570	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
24	NC_006570	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707188
25	NC_006570	TGAT	2	8	815	822	25 %	50 %	25 %	0 %	56707188
26	NC_006570	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
27	NC_006570	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	56707188
28	NC_006570	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707188
29	NC_006570	GTAC	2	8	1102	1109	25 %	25 %	25 %	25 %	56707188
30	NC_006570	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
31	NC_006570	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
32	NC_006570	GCTT	2	8	1198	1205	0 %	50 %	25 %	25 %	56707188
33	NC_006570	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	56707188
34	NC_006570	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707188
35	NC_006570	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707188
36	NC_006570	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
37	NC_006570	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707188
38	NC_006570	ATGC	2	8	1429	1436	25 %	25 %	25 %	25 %	56707188
39	NC_006570	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707188
40	NC_006570	TAAA	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	56707188
41	NC_006570	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	56707189
42	NC_006570	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
43	NC_006570	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
44	NC_006570	AGTT	2	8	1731	1738	25 %	50 %	25 %	0 %	56707189
45	NC_006570	TGAT	2	8	1814	1821	25 %	50 %	25 %	0 %	56707189
46	NC_006570	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
47	NC_006570	AGCA	2	8	1928	1935	50 %	0 %	25 %	25 %	56707189
48	NC_006570	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707189
49	NC_006570	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707189
50	NC_006570	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
51	NC_006570	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707189
52	NC_006570	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707189
53	NC_006570	A	7	7	2151	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	56707189
54	NC_006570	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707189
55	NC_006570	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
56	NC_006570	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
57	NC_006570	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
58	NC_006570	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707189
59	NC_006570	TCTA	2	8	2572	2579	25 %	50 %	0 %	25 %	56707189
60	NC_006570	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
61	NC_006570	GTTT	2	8	2630	2637	0 %	75 %	25 %	0 %	56707189
62	NC_006570	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
63	NC_006570	ATA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707190
64	NC_006570	TAG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
65	NC_006570	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
66	NC_006570	CAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707190
67	NC_006570	CTT	3	9	3463	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
68	NC_006570	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	56707190
69	NC_006570	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	56707190
70	NC_006570	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	56707190
71	NC_006570	T	7	7	3658	3664	0 %	100 %	0 %	0 %	56707190
72	NC_006570	CTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
73	NC_006570	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
74	NC_006570	GAT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
75	NC_006570	TCAA	2	8	3780	3787	50 %	25 %	0 %	25 %	56707190
76	NC_006570	CAAC	2	8	3819	3826	50 %	0 %	0 %	50 %	56707190
77	NC_006570	AAC	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707190
78	NC_006570	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	56707190
79	NC_006570	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
80	NC_006570	ATTA	2	8	3947	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	56707190
81	NC_006570	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
82	NC_006570	AT	3	6	4722	4727	50 %	50 %	0 %	0 %	56707191
83	NC_006570	TTTGC	2	10	4736	4745	0 %	60 %	20 %	20 %	56707191
84	NC_006570	AATA	2	8	4868	4875	75 %	25 %	0 %	0 %	56707191
85	NC_006570	CGTAC	2	10	4880	4889	20 %	20 %	20 %	40 %	56707191
86	NC_006570	AGT	3	9	4949	4957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707191
87	NC_006570	AGC	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707191
88	NC_006570	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
89	NC_006570	TTA	2	6	5045	5050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
90	NC_006570	AGC	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707191
91	NC_006570	AGA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707191
92	NC_006570	T	6	6	5100	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	56707191
93	NC_006570	GAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707191
94	NC_006570	TCT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707191
95	NC_006570	TACT	2	8	5160	5167	25 %	50 %	0 %	25 %	56707191
96	NC_006570	T	6	6	5177	5182	0 %	100 %	0 %	0 %	56707191
97	NC_006570	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707191
98	NC_006570	TTCAA	2	10	5251	5260	40 %	40 %	0 %	20 %	56707191
99	NC_006570	TTG	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
100	NC_006570	CTA	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707191
101	NC_006570	TTGCG	2	10	5339	5348	0 %	40 %	40 %	20 %	56707191
102	NC_006570	CTG	3	9	5355	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
103	NC_006570	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707191
104	NC_006570	ATT	2	6	5516	5521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
105	NC_006570	CTAT	2	8	5579	5586	25 %	50 %	0 %	25 %	56707191
106	NC_006570	ATT	2	6	5590	5595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
107	NC_006570	CTG	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
108	NC_006570	TTG	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
109	NC_006570	TGTT	2	8	5826	5833	0 %	75 %	25 %	0 %	56707191
110	NC_006570	TA	3	6	5835	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	56707191
111	NC_006570	GTT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
112	NC_006570	TCG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707192
113	NC_006570	GGT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707192
114	NC_006570	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
115	NC_006570	TTA	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
116	NC_006570	GAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
117	NC_006570	CGT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707192
118	NC_006570	ATTA	2	8	6463	6470	50 %	50 %	0 %	0 %	56707192
119	NC_006570	ATA	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707192
120	NC_006570	GATA	2	8	6671	6678	50 %	25 %	25 %	0 %	56707192
121	NC_006570	TGA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
122	NC_006570	AGAT	2	8	6744	6751	50 %	25 %	25 %	0 %	56707192
123	NC_006570	TGA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
124	NC_006570	GA	3	6	6797	6802	50 %	0 %	50 %	0 %	56707192
125	NC_006570	AGA	2	6	6943	6948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
126	NC_006570	GAT	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
127	NC_006570	TTG	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
128	NC_006570	AT	3	6	7108	7113	50 %	50 %	0 %	0 %	56707192
129	NC_006570	A	6	6	7165	7170	100 %	0 %	0 %	0 %	56707192
130	NC_006570	GAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
131	NC_006570	TGAT	2	8	7197	7204	25 %	50 %	25 %	0 %	56707192
132	NC_006570	TAT	2	6	7230	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
133	NC_006570	TAA	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707192
134	NC_006570	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
135	NC_006570	GAT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
136	NC_006570	ATGCA	2	10	7386	7395	40 %	20 %	20 %	20 %	56707192
137	NC_006570	AGTT	2	8	7417	7424	25 %	50 %	25 %	0 %	56707192
138	NC_006570	AGA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
139	NC_006570	TTA	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
140	NC_006570	GGT	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707192
141	NC_006570	TGA	3	9	7573	7581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
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143	NC_006570	TTA	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
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147	NC_006570	TG	3	6	11439	11444	0 %	50 %	50 %	0 %	56707193
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163	NC_006570	TAT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707193
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402	NC_006570	ATTT	2	8	24372	24379	25 %	75 %	0 %	0 %	56707205
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